डीआरडीओ के रजत जयंती वर्ष (1983) में, डीएफआरएल को श्रेष्ठ विज्ञान प्रयोगशाला निर्णित किया गया। समारोह के चिन्ह स्वरूप नया "टाइटेनियम ट्रॉफी" को इस प्रयोगशाला को खाद्यान्न विकास मुख्यतः सैन्य बलों अंटार्कटिक अभियान और बाह्य उपग्रह मिशन में महत्वपूर्ण योगदान करने के लिए दिया गया। प्रगति मैदान, नई दिल्ली में 13, जनवरी 1984 को संपन्न एक रंगारंग पुरस्कार समारोह में प्रधानमंत्री श्रीमती इंदिरा गांधी द्वारा प्रयोगशाला एवं इसके कर्मचारियों की ओर से निदेशक, डॉ. टी.आर. शर्मा ने रॉलिंग ट्राफी प्राप्त किया।

• डॉ. जीवरत्नम को फेलो ऑफ इंडियन एसोसिएशन ऑफ बायोमेडिकल साइंटिस्ट्स प्रदान किया गया।
• डॉ. वी ए संजीव कुमार को डीआरडीओ युवा वैज्ञानिक पुरस्कार, 2002 प्रदान किया गया।
• के कावेरी और श्री डी.के. दास गुप्ता के शोध पत्र "संतरे के रस के प्रसंस्करण के लिए झिल्ली तकनीक की उपयोगिता" की "बीवेरेज एंड फूड वर्ल्ड" पत्रिका में जून 2001 के अंक में प्रकाशन होने पर 2001 में जे.एस. प्रूथी पुरस्कार के लिए "सर्वोत्तम नवीनतम शोध एवं विकास पत्र" के रूप में निर्णित हुआ। श्री डी.के. दास गुप्ता ने पुरस्कार को मुंबई में 27.05.2003 को आयोजित एक कार्यक्रम में प्राप्त किया।

डीआरडीओ का प्रदर्शन श्रेष्ठता पुरस्कार वर्ष 2003 के लिए डॉ.। एएस बावा, निदेशक, डीएफआरएल ने माननीय प्रधानंत्री डॉ. मनमोहन सिंह से विज्ञान भवन, नई दिल्ली में 17, मई 2005 में आयोजित एक कार्यक्रम में प्राप्त किया। यह पुरस्कार एवं प्रशस्ती पत्र शोधित पाउच प्रसंस्करण तकनीक - खाने योग्य खाद्यान्न पदार्थों के संरक्षण के सफलतापूर्वक विकास, साथ ही 12 महीनों के स्वजीवन सेना एवं नागरिक के लिए दिया गया।